本发明公开了一种快速鉴定弓背青鳉遗传性别的引物及其应用。首先通过分子生物学和生物信息学方法分析弓背青鳉常染色体基因和Y染色体基因的序列信息,找到了两条在弓背青鳉常染色体和Y染色体中部分同源的DNA片段,其常染色体上DNA片段序列如SEQ ID NO:1所示,命名为SEQchrA;其Y染色体上DNA片段长度序列如SEQ ID NO:2所示,命名为SEQchrY;同时,针对上述DNA片段设计特异性引物进行弓背青鳉遗传性别鉴定,可以快速、准确的区分弓背青鳉遗传性别,所述方法可用于不同发育时期弓背青鳉的遗传性别鉴定,对研究弓背青鳉性别决定和分化机制、实现其性别控制具有重要意义,具有较大的应用前景。