本发明公开了一种具有强杀菌效果的杂合抗菌蛋白及其应用,所述的具有强杀菌效果的杂合抗菌蛋白,包括如SEQ ID NO 1所示的氨基酸序列,命名为AB469,以及由所述的AB469的催化域相似的序列组成的杂合蛋白、由所述的AB469的结合域相似的序列组成的杂合蛋白或由AB469的催化域和结合域位置互换组成的杂合蛋白。本发明的杂合抗菌蛋白,利用大肠杆菌或者酵母菌等进行表达,纯化后获得高纯度的杂合抗菌蛋白;该蛋白能快速裂解鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌、沙门氏菌、大肠杆菌等革兰氏阴性菌。由该抗菌蛋白制成的抗菌制剂可用于预防和治疗细菌感染,可制成抗菌制剂用于预防和治疗细菌感染,以及医疗器械和医疗场所的杀菌等。