本发明涉及生物技术领域,具体公开一种小麦抗叶锈病蛋白及其编码基因和应用。所述小麦抗叶锈病蛋白其具有如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列,或者具有如SEQ ID NO:1所述的氨基酸序列经缺失、替换或添加一个或多个氨基酸得到的具有提高小麦抗叶锈病功能的氨基酸序列,所述小麦抗叶锈病蛋白或编码其的基因可应用于调控或提高小麦抗叶锈病性能。本发明提供了小麦抗叶锈病蛋白,并具体公开了所述小麦抗叶锈病蛋白的氨基酸序列,在小麦中提高该小麦抗叶锈病蛋白的表达量能够显著提高小麦对叶锈病的抵抗能力,其对于小麦抗叶锈病育种具有重大的应用推广价值。