本发明属于猪遗传标记制备与应用技术领域。具体涉及猪甘丙肽样肽GALP编码基因第2外显子的单核苷酸多态性(SNP)检测领域。其步骤包括:从猪血液中提取基因组DNA,设计引物,PCR扩增,PCR产物克隆、测序,序列比较分析,单核苷酸多态性检测,标记与产仔数性状间相关性分析。公开了猪GALP基因第3外显子的DNA序列和SNP分型的检测技术。本发明的遗传标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示,在上述序列的1157位bp处有一个碱基突变(C/G),并导致HhaI-RFLP多态性。本发明还公开了该遗传标记的制备方法及在猪产仔数标记辅助选择中的应用。
本发明属于猪遗传标记制备与应用技术领域。具体涉及猪连环蛋白α样1CTNNAL1编码基因第14外显子的单核苷酸多态性(SNP)检测技术领域。其步骤包括:从猪血液中提取基因组DNA,设计引物,PCR扩增,PCR产物克隆、测序,序列比较分析,单核苷酸多态性检测,标记与产仔数性状间相关性分析。本发明公开了猪CTNNAL1基因第14外显子的DNA序列和SNP分型的检测技术。本发明的遗传标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示,在序列表SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3序列646位碱基处有一个碱基突变C/G,并导致AluI-RFLP多态性。本发明公开了该遗传标记的制备方法及其在猪产仔数标记辅助选择中的应用。
本发明属于猪分子标记制备技术领域,具体涉及一种猪CKM的5’侧翼启动子片段作为猪胴体性状的遗传标记及制备方法与应用。该遗传标记具有序列表SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列。其特征在于该序列的第82bp处分别存在一个A/G和G/A的突变,引起DraIII-RFLP的多态性。利用该遗传标记对大白猪和梅山猪F2代进行了与猪胴体性状的关联分析,检测了含有不同基因型的大白猪和梅山猪肌肉组织中CKM的表达量。本发明还公开了该遗传标记的分型检测方法,为猪胴体性状分子标记辅助选择提供了新的遗传标记和检测方法。
本发明属于猪的动物生物技术与育种领域,具体涉及猪异柠檬酸脱氢酶基因IDH3β的启动子的克隆、活性分析和启动子区突变研究。本发明的步骤包括:从猪血液中提取基因组DNA,设计引物,采用TAIL-PCR技术经过两轮扩增获得猪IDH3β基因上游5’侧翼2447bp的基因组碱基序列,并进行序列比较分析和遗传变异检测;采用5’端缺失策略扩增IDH3β基因上游5’侧翼区,将获得的DNA序列构建荧光素酶报告基因载体,测定其启动子活性,鉴定IDH3β基因启动子。本发明克隆的猪异柠檬酸脱氢酶基因IDH3β的启动子的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:4所示。本发明为猪的遗传改良应用提供了基因资源。
本发明属于猪遗传标记制备与应用技术领域,具体涉及一种猪miR-27a前体侧翼基因片段作为猪产仔数性状的遗传标记,其制备方法与应用。本发明获得了一种与猪产仔数性状相关的遗传标记,它包含猪miR-27a前体侧翼基因片段,它是序列表SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列;在序列表SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5序列的461bp处有一个C461-T461的碱基突变,该突变导致PCR-HpaII-RFLP多态性。设计了扩增miR-27a前体侧翼基因片段的引物,其核苷酸序列如SEQ ID NO:6和SEQ ID NO:7所示。本发明公开了该遗传标记的制备方法及其在猪标记辅助选择中的应用。