本发明涉及一种调控杨树生长量的油菜素内酯合成基因PtoCYP90D1及其应用,属于基因工程技术领域。一种调控杨树生长量的油菜素内酯合成基因PtoCYP90D1,所述油菜素内酯合成基因PtoCYP90D1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明通过将PtoCYP90D1基因转入杨树,过量表达PtoCYP90D1的转基因杨树与野生型相比,明显增高、增粗,且木质部细胞数量明显增多,同时转基因干鲜重增加,木质素纤维素变化,说明PtoCYP90D1基因是调控杨树生物量的关键调节基因,在林木基因工程领域和无性系林业领域有重要的应用价值。