本发明涉及一种盐藻中钠磷共转运通道1；2基因、其编码蛋白及其克隆方法。该基因具有SEQ NO 1所示的碱基序列。本发明通过对盐藻BAC克隆DNA的“鸟枪”法测序，在连续的盐藻基因组序列中发现盐藻钠磷共转运通道1基因(DvSPT1)和不同于已知的盐藻钠磷共转运通道1；2基因(DvSPT1；2)。它们可能起源于盐藻基因组序列的复制，并且在6个不同盐稳态条件下DvSPT1；2的表达量要大于DvSPT1，它们的表达趋势也发生了分化。当盐藻处在极端高盐浓度条件下(5M NaCl)时，DvSPT1；2可能担负起主要功能，它增加了盐藻对于更宽盐浓度的适应性。而DvSPT1；2响应高盐或磷“饥饿”胁迫时的诱导表达趋势与DvSPT1类似，在功能上可能与盐藻细胞中的无机磷的转运，促进甘油合成，维持对外界高渗胁迫的适应有关。本发明在研究植物抗盐机制上具有一定的理论意义。
