本发明涉及植物基因工程领域,特别是涉及一种枣ZjCLA基因的VIGS沉默载体及其应用。本发明提供了特异性片段在构建枣ZjCLA基因的VIGS沉默载体中的应用,所述特异性片段包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的序列,所述枣ZjCLA基因包括序列号为XM_048477782.1的基因。利用本发明提供的特异性片段构建的VIGS沉默载体,可以成功侵染枣实生苗,诱导枣内源ZjCLA发生沉默,有效降低了枣ZjCLA基因的表达水平,获得病毒诱导的基因沉默性状,能够验证枣ZjCLA基因的功能,在枣的功能基因研究中具有应用价值。另外,本发明还建立了枣高效VIGS体系,为枣功能基因组学研究提供技术支撑。