本发明公开了一种水稻类病斑突变体基因SCYL2，所述水稻类病斑突变体基因SCYL2的核苷酸序列是SEQ ID No.1所示的核苷酸序列中通过添加、替换或缺失一个或几个碱基生成的核苷酸序列，其编码的蛋白能够调控水稻类病斑形成。SCYL2基因的突变激活水稻中抗病相关基因的表达，对稻瘟病和白叶枯病的抗性显著增强。该基因的发现和克隆为水稻抗稻瘟病和白叶枯病抗性育种提供了新的基因资源。
本发明涉及一种鉴定水稻香味等位基因Badh2‑E2的PCR/LDR分子标记和方法，属于水稻育种技术领域。本发明所述分子标记包括一对PCR引物和三条LDR探针，PCR引物对正向引物序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物序列如SEQ ID NO.2所示。LDR探针包括一条荧光标记探针Probe‑FAM，序列如SEQ ID NO.3所示，一条非Badh2‑E2等位基因特异探针Probe‑non，序列如SEQ ID NO.4所示，一条Badh2‑E2等位基因特异探针Probe‑E2，序列如SEQ ID NO.5所示。本发明方法不仅能准确快速的鉴定水稻品种或育种群体中各个株系中是否携带Badh2‑E2等位基因，而且能实现较多样品的高通量检测。
