本发明提供了一种同时生产倍半萜和初级代谢产物的重组微生物及其应用，所述初级代谢产物包括泛酸、角鲨烯、脂肪酸和维生素B2中的至少一种；所述菌株含有甲羟戊酸途径、β‑法尼烯合成基因和初级代谢产物合成的相关基因；所述甲羟戊酸途径的相关基因包括ERG10、ERG13、tHMG1、ERG12、ERG8、MVD1、IDI1和ERG20基因，拷贝数为ERG10：ERG13：tHMG1：ERG12：ERG8：MVD1：IDI1：ERG20＝2：2：X：2：2：2：2：2，X为≥1的整数；所述β‑法尼烯合成基因包括bFS，序列如SEQ ID NO.1所示。本发明在生产倍半萜化合物的同时实现初级代谢产物高产。
本发明公开了获得α‑法尼烯以及β‑法尼烯的重组微生物及其构建方法，属于合成生物学领域。本发明获得了性能优异的α‑法尼烯合酶和β‑法尼烯合酶，包括序列如SEQ ID NO.1‑6所示的α‑法尼烯合酶或β‑法尼烯合酶。本发明的重组微生物在CEN.PK2‑1D的基础上，含有5个法尼烯合酶基因，含有额外的MVA途径基因ERG10、ERG13、tHMG1、ERG12、ERG8、MVD1、IDI1，以及额外一个ERG20和一个tHMG1基因。
