“朱香元”申请（专利权）人搜索_中国专利权人_发明人_技术持有人_科研专家_钻瓜专利网

钻瓜专利网为您找到相关结果2个，建议您升级VIP下载更多相关专利

[发明专利]基于CPU+GPU异构系统的序列比对方法-CN201410522707.9有效
发明人： 朱香元 -专利权人：肇庆学院
申请日： 2014-09-29 - 公布日： 2018-09-28 - 主分类号： G06F19/22 文献下载
摘要：公开了一种大规模生物序列比对及其基于异构系统的并行处理方法。首先，对序列优化存储，设计异构系统负载平衡方法；然后，设计异构系统内存优化方法，包括满足合并访问条件的序列存储方法、相似矩阵存储和访问方式、得分矩阵压缩存储，解决由于异构系统存储空间的匮乏而导致的实际计算性能低下；最后，基于内存预分配和复用策略，提出粗粒度序列比对并行方法。本发明基于CPU+GPU异构计算平台，充分利用了负载平衡和内存优化技术，从而显著提高大规模生物序列比对的处理效率。
基于 cpu gpu 系统序列方法

[发明专利]一种运行于多核计算机平台的并行通用序列的比对方法-CN201410491798.4在审
发明人：李肯立;朱香元;唐卓;徐雨明;李克勤;肖正 -专利权人：湖南大学
申请日： 2014-09-24 - 公布日： 2014-12-24 - 主分类号： G06F19/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种运行于多核计算机平台的并行通用序列的比对方法，首先利用聚类方法(Cluster)对待比对序列集进行分类，得到大小不等的子序列集合(C₁，C₂，……，C_m)。然后，应用分配方法(Distribute)将待比对的子序列集合分配到各计算核上(Core₁，Core₂，……，Core_n)，以各个核上的负载平衡为分配的最终目标。接着，应用现有的序列比对方法对各子序列集合分别进行比对(Align)。最后，应用合并方法(Merge)，将已比对的子序列集合合并，得到待比对序列集的最终比对结果。本发明基于多核计算平台，充分利用了数据并行的计算策略，从而显著提高生物序列比对的处理效率。
一种运行多核计算机平台并行通用序列方法