本发明公开了一种花特异性启动子及其应用。本发明所提供的启动子为如下任一：a)SEQ ID No.4所示的DNA分子；b)与a)限定的核苷酸序列具有99％以上、95％以上、90％以上、85％以上或者80％以上同源性，且具有启动子功能的DNA分子；c)在严格条件下与a)或b)限定的核苷酸序列杂交，且具有启动子功能的DNA分子。本发明通过正反两项融合两个MdAG基因的第二内含子与最小35S启动子建立四个载体，通过实验证明SEQ ID No.4所示的rMdAG2I启动子在烟草和苹果属中的花特异性。本发明的结果表明rMdAG2I启动子在苹果属植物花性状的遗传改良中拥有巨大前景。
