本发明涉及一种融合表达含有二硫键蛋白质的方法。具体涉及一种在真核宿主细胞中,融合表达重组蛋白质,特别是活性与二硫键的形成(链内和链间)密切相关的真核重组蛋白质的方法。通过一种融合重组人蛋白质二硫键异构酶(human protein disulphide isomerase,hPDI)或者融合其突变体的方法,在巴斯德毕赤酵母表达系统中,表达外源重组蛋白。该方法适合表达蛋白活性或蛋白折叠(包括单体、二聚体或多聚体形式)有耐于二硫键的正确形成的真核外源蛋白质。通过这种方式表达的蛋白质容易被细胞分泌出胞外,产量高,产物不会大量聚集,产物容易被捕获及纯化,而且得到的目的蛋白N末端均一,活性高。该方法表达的重组蛋白质,有利于进行工业化大规模生产。