[发明专利]用于癌症转移的诊断和治疗的方法

说明书

本发明涉及用于预后癌症中骨转移的方法，所述方法包括使用探针来测定所关注的基因在原发性肿瘤样品中是否扩增。同样，本发明还涉及用于测定相对于其他器官的转移，发展成骨转移的趋势的方法，所述方法包括使用探针来测定所关注的基因的表达水平或所关注的基因的扩增或易位。本发明还涉及用于预测在患有癌症的受试对象中早期骨转移的方法。本发明还涉及作为治疗剂用于治疗癌症转移的c‑MAF抑制剂。本发明涉及用于预测骨转移和预测患有骨转移的受试对象的临床结果的试剂盒。最后，本发明涉及用于将患有癌症的受试对象分型以及将患有癌症的受试对象分类成队列的方法。

参照序列表

与本申请一起提交的、电子送达的序列表(2014年3月13日创建，“3190_008PC01_SEQIDListing_ascii.txt”，48,452字节)的内容以引用方式全文并入本文。

发明背景

技术领域

本发明涉及检测遗传异常和基于其对骨转移进行预后。在一个实施方案中，本发明涉及使用探针在原发性肿瘤样品中测定所关注的基因的水平。同样，本发明还涉及用于在患有癌症的受试对象中设计定制治疗的方法，其包括使用例如探针来测定样品中所关注的基因的水平。在一个实施方案中，所关注的基因选自：MAF,VAT1L,CLEC3A,WWOX和5srRNA。在另一个实施方案中，癌症选自：乳腺癌、肺癌、前列腺癌、甲状腺癌和肾癌。

问题

在实体肿瘤患者中，转移(在不同的至关重要的器官中，在肿瘤细胞与周围正常组织之间，由精细复杂的相互作用而导致的复杂的过程)占所有癌症死亡的90％。必须了解导致原发性肿瘤形成转移的分子和细胞机制，以便更好地解决这种主要的威胁生命的问题。转移基因和机制的识别对于理解这种致命的状况及其对于临床实践的意义是必不可少的。之前的工作让人感觉到转移过程的复杂性，但是没能说明转移是如何并且为什么发生，什么机制使得转移成为组织特异性的过程，什么事件使得在移除原发性肿瘤后多年、休眠的转移变成活性且致命的，以及什么转移介导基因最终构成了有价值的诊断标志物和治疗靶物。

本发明基于以下认识：对可以预测骨转移的标志物的识别可以通过对癌细胞引起的骨转移组织的散布和移殖加以限制从而提供预防性的治疗机会，并延迟或改变致死状况。因此，例如已经显示MAF(除了其他潜在的机制以外，16q22-24(16q23)扩增或16q23易位所需的真正的乳腺癌骨转移基因、蛋白质和mRNA的累积)还驱使了癌症骨转移性病变，在优选的实施方案中，驱使了溶骨性癌症的骨转移。

发明概述

本发明人确定，对信号(会影响散播的癌细胞的骨转移)平衡的识别将为建立预后和针对疾病的预防性治疗干预提供有价值的线索。

因此，在一个方面中，本发明涉及用于预测、诊断或预后在患有癌症(例如乳腺癌、肺癌、前列腺癌、甲状腺癌或肾癌)的受试对象中所述的癌症骨转移的体外方法，该方法包括：

i)测定或定量在所述的受试对象的样品中所关注的基因的表达水平或拷贝数变化，以及

ii)将在步骤i)中获得的表达水平或拷贝数与参照值比较，

其中所述的基因的表达水平或拷贝数相对于所述的参照值升高表明发展成骨转移的风险增加。

在另一个方面中，本发明涉及用于预测患有癌症(例如乳腺癌、肺癌、前列腺癌、甲状腺癌或肾癌)的患者的临床结果的体外方法，该方法包括：

i)定量在所述的受试对象的样品中所关注的基因的表达水平或拷贝数，以及

ii)将在步骤i)中获得的表达水平或拷贝数与参照值比较，

其中所述的基因的表达水平或拷贝数相对于所述的参照值升高表明不良的临床结果。