[发明专利]一种性状相关基因的筛选方法及其系统有效

专利信息
申请号: 202211277659.2 申请日: 2022-10-19
公开(公告)号: CN115588465B 公开(公告)日: 2023-05-23
发明(设计)人: 苏建忠;马云龙;邓春玉;瞿佳 申请(专利权)人: 温州医科大学
主分类号: G16B20/40 分类号: G16B20/40;G16B20/30;G06N20/00
代理公司: 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 代理人: 李红伟
地址: 325035 浙江*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明公开了一种性状相关基因的筛选方法、系统、设备和计算机可读存储介质,方法其包括:获取单细胞测序数据;采用机器学习的方法对所述单细胞测序数据及通路数据进行处理,得到细胞通路的PAS评分矩阵和细胞通路的PAS;获取遗传关联数据,并基于通路数据,将所述遗传关联数据中的SNPs注释到通路数据中,得到单条通路数据中所有SNPs的遗传效应值;利用所述遗传关联数据的多基因回归模型,基于所述PAS和通路数据中每个SNP的遗传效应值,对所述遗传效应值的分布进行参数估计,得到估计系数;对估计系数和PAS进行处理得到细胞的遗传相关通路活性评分gPAS;对所述遗传相关通路活性评分gPAS与每个细胞的基因表达量进行相关性分析并排序,筛选出N个性状相关基因。
搜索关键词: 一种 性状 相关 基因 筛选 方法 及其 系统
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