本发明公开了一株互隔交链孢霉、除草剂及其应用,所述互隔交链孢霉被命名为互隔交链孢霉(Alternaria alternata)JM,在2021年11月10日,该互隔交链孢霉JM被保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,保藏号为:CGMCC No 23848。该菌株对播娘蒿具有高侵染性,致病率高,可将该菌作为除草剂的活性成分应用于田间播娘蒿的防治。互隔交链孢霉JM菌的致病性具有高选择性,对小麦、芝麻、油菜、红豆、绿豆常见经济等非常安全,其具有使用安全、不会诱发播娘蒿的抗药性、环境安全性高的优点,在播娘蒿的防治方面具有很好的发展前景。