本发明属于生物医学技术领域,公开了一种重组人CDC5L融合蛋白水凝胶、制备方法及应用,融合蛋白包括CDC5L蛋白序列和穿膜肽序列,所述CDC5L蛋白序列和所述穿膜肽序列通过连接肽连接;CDC5L蛋白的氨基酸序列为SEQ ID NO:1,所述融合蛋白的氨基酸序列为SEQ ID NO:2,所述融合蛋白的核苷酸序列为SEQ ID NO:3。本发明在心肌缺血损伤后通过缺血边缘区心肌内局部注射给药可通过激活心肌增殖再生的关键通路来促进心肌细胞细胞周期进程、DNA合成和有丝分裂等生物学活动,促进心肌细胞增殖,达到减少心肌缺血梗死面积和瘢痕形成,减少心梗后心脏损伤,促进心功能恢复的治疗作用。