[发明专利]一种胃癌诊断试剂盒及其应用

说明书

本发明公开了一种胃癌诊断试剂盒及其应用，涉及生物技术领域。所述的试剂盒中包含探针，所述的探针为针对人类染色体靶区域的相同序列，本发明的胃癌诊断试剂盒的灵敏度和特异性较高，所述的灵敏度为74％，特异性为91％。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种胃癌诊断试剂盒及其应用。

背景技术

胃癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一，我国胃癌的特点是早期病例占比低，而晚期肿瘤具有高度的异质性和侵袭性，所以治疗效果相对不佳。因此，胃癌的早期筛查成为了胃癌干预的非常重要的手段。但是由于医疗检查资源的相对不足以及人们对胃肠镜检查的抵触导致早期胃肠癌诊断率不及预期。目前胃癌诊断技术主要是影像学检测技术(如：纤维胃镜检查及活检、x线钡餐检查)、细胞学检测技术(如：胃液细胞学检查)，然而，这些技术检测灵敏性低，侵入性强，短时间内我国还无法通过胃镜检查对胃癌进行大规模筛查。肿瘤生物标志物(如：胃蛋白酶原)检测技术具有方便、快捷、灵敏、无创等技术优势。

中国专利CN202110466630.8中公开了一种胃癌诊断标志物及其应用，该发明以外泌体linc02465作为诊断标志物，利用外泌体linc02465在幽门螺杆菌感染胃癌患者和健康人生物样本中表达水平的差异，可作为胃癌中期诊断标志物。上述样品采集，具有无创性、制备方法简单、成本较低的优势，适用于作为胃癌早期筛查手段广泛推广使用。但是单一肿瘤标志物难以实现理想的肿瘤检测性能。因此亟需一种有效的胃癌早筛的生物标志物和技术手段，提升胃癌患者的存活率，并缓解我国胃癌检查中医疗资源紧张的问题。

随着液体活检技术的开发，可通过检测细胞游离DNA(cell free DNA，cfDNA)中的肿瘤信号进行肿瘤早筛。cfDNA是细胞释放到血浆中的降解的DNA片段。正常人体的cfDNA主要是通过细胞凋亡产生小而均匀的185-200bp小片段DNA，而肿瘤在进展过程中由于肿瘤细胞非正常的凋亡，产生大小不同的异常cfDNA片段。应用Cancerseek和EPIC-seq等方法可以通过检测cfDNA突变进行多种癌症的早筛，但是研究发现大量的cfDNA突变(81.6％来自于健康人，53.2％来自于癌症患者)都是白细胞的克隆性造血引起的，这暗示出检测cfDNA的突变并不是理想特征。

有研究提出cfDNA中的甲基化可以用于溯源组织，但是目前这种方法的建库方式较为复杂，并且该性能仍不满足大规模筛查的需求。近些年，cfDNA中的肿瘤新特征被发现，用于更好地鉴定肿瘤信号，但是对于胃癌来说，并没有一套用于检测胃癌特定染色质开放区间的探针组合物，实现更好地筛查性能。

发明内容

本发明的目的是提供一种胃癌诊断试剂盒，所述的试剂盒中包括特异性核酸组合物，本发明的试剂盒在检测胃癌时的灵敏度和特异性较高。

为实现上述发明目的，本发明的技术方案如下：

第一方面，本发明提供了一种胃癌诊断试剂盒，包含探针，所述的探针为针对人类染色体下述靶区域的相同序列：

优选地，所述的探针为针对人类染色体下述靶区域的相同序列：

进一步优选地，所述的试剂盒包含28238条探针，所述的探针序列为人类参考基因组hg38版本的下述片段的相同序列：

chr1的片段包括：