[发明专利]一种胃癌诊断试剂盒及其应用在审
| 申请号: | 202310809171.8 | 申请日: | 2023-07-04 |
| 公开(公告)号: | CN116656827A | 公开(公告)日: | 2023-08-29 |
| 发明(设计)人: | 蓝勋;王莉惠 | 申请(专利权)人: | 人科(北京)生物技术有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;G16B20/20;G16H50/30 |
| 代理公司: | 北京精金石知识产权代理有限公司 11470 | 代理人: | 张黎 |
| 地址: | 100085 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 胃癌 诊断 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种胃癌诊断试剂盒,其特征在于,包含探针,所述的探针为针对人类染色体下述靶区域的相同序列:
2.根据权利要求1所述的胃癌诊断试剂盒,其特征在于,所述的探针为针对人类染色体下述靶区域的相同序列:
3.根据权利要求2所述的胃癌诊断试剂盒,其特征在于,包含28238条探针,所述的探针序列为人类参考基因组hg38版本的下述片段的相同序列:
chr1的片段包括:
chr2的片段包括:
chr3的片段包括:
chr4的片段包括:
chr5的片段包括:
chr6的片段包括:
chr7的片段包括:
chr8的片段包括:
chr9的片段包括:
chr10的片段包括:
chr11的片段包括:
chr12的片段包括:
chr13的片段包括:
chr14的片段包括:
chr15的片段包括:
chr16的片段包括:
chr17的片段包括:
chr18的片段包括:
chr19的片段包括:
chr20的片段包括:
chr21的片段包括:
chr22的片段包括:
chrX的片段包括:
chrY的片段包括:
4.一种权利要求1-3任一项所述的胃癌诊断试剂盒的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)对靶点区域进行探针捕获;
(2)通用引物扩增建库;
(3)对探针捕获后的数据进行测序,将测序结果带入模型;
(4)模型判定待测样本的阴阳性及患胃癌的风险。
5.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,所述的探针检测cfDNA中的染色质开放区间。
6.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,所述的试剂盒的检测样本选自血浆、血清、全血、分离的血细胞、活检组织、组织切片、石蜡包埋的组织、体液、细胞中的一种或多种。
7.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,所述的步骤(3)中的模型为人工智能模型;所述的人工智能模型选自机器学习模型、深度学习模型中的一种或多种。
8.根据权利要求7所述的检测方法,其特征在于,所述的机器学习模型选自随机森林模型、svm模型、glmnet模型、GBM模型中的一种或多种。
9.根据权利要求7所述的检测方法,其特征在于,所述的深度学习模型选自RNN模型、CNN模型、standardNN模型、图神经网络模型中的一种或多种。
10.权利要求1-3中任一项所述的胃癌诊断试剂盒在制备胃癌诊断产品中的应用。
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