[发明专利]与美洲南瓜侧枝多少相关基因紧密连锁的分子标记及应用在审
| 申请号： | 202310213720.5 | 申请日： | 2023-03-07 |
| 公开（公告）号： | CN116497144A | 公开（公告）日： | 2023-07-28 |
| 发明（设计）人： | 李严曼;朱磊;王永;杨路明;孙守如;胡德菊 | 申请（专利权）人： | 河南农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京华际知识产权代理有限公司 11676 | 代理人： | 袁瑞红 |
| 地址： | 450002 河*** | 国省代码： | 河南;41 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 美洲 南瓜 侧枝 多少 相关 基因 紧密 连锁 分子 标记 应用 | ||
1.与美洲南瓜侧枝数量相关基因紧密连锁的分子标记，其特征在于，所述分子标记为Indel415和Indel555，位于美洲南瓜第2号染色体上，所述分子标记Indel415对应的引物对序列为：
Indel415-F：AAGCTTCACCACTTTGAGACA；
Indel415-R：TGACTCGAACAACCTGAATCA；
所述分子标记Indel555对应的引物对序列为：
Indel555-F：AGCTTCATGTTTATGCCCAGT；
Indel555-R：ACGTCCAATTGTTAGTGCGT。
2.权利要求1中所述的分子标记在美洲南瓜分子标记辅助育种中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述分子标记用于鉴定或辅助鉴定美洲南瓜侧枝数量性状。
4.权利要求1所述的分子标记在美洲南瓜侧枝数量相关基因定位中的应用。
5.一种美洲南瓜侧枝数量性状鉴定方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：
(1)提取待测美洲南瓜基因组DNA；
(2)以步骤(1)中所提取基因组DNA为模板，利用权利要求1所述分子标记的引物对进行PCR扩增，对PCR扩增产物进行电泳检测和/或测序；
(3)根据步骤(2)的电泳条带和/或测序结果进行判定，具体标准为：
对于分子标记Indel415，利用引物对Indel415-F、Indel415-R，如果PCR扩增产物为如SEQ ID NO.5所示的长度为215bp的特征条带，则美洲南瓜为少/无侧枝类型；如果PCR扩增产物为如SEQ ID NO.5所示的长度为230bp的特征条带，或者既有一条如SEQ ID NO.5所示的长度为215bp的特征条带，又有一条如SEQ ID NO.6所示的长度为230bp的特征条带，则美洲南瓜为多侧枝类型；
对于分子标记Indel555，利用引物对Indel555-F、Indel555-R，如果PCR扩增产物为如SEQ ID NO.7所示的长度为244bp的特征条带，则美洲南瓜为少/无侧枝类型；如果PCR扩增产物为如SEQ ID NO.8所示的长度为231bp的特征条带，或者既有一条如SEQ ID NO.7所示的长度为244bp的特征条带，又有一条如SEQ ID NO.8所示的长度为231bp的特征条带，则美洲南瓜为多侧枝类型。
6.一种用于美洲南瓜侧枝数量性状的试剂盒，其特征在于，包含权利要求1中所述的任何一对或者两对引物对。
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