[发明专利]一种蛋白互作抑制肽的设计方法

权利要求书

1.一种蛋白互作抑制肽的设计方法，包含至少2个具有相互作用蛋白质的互作蛋白质组，其特征在于，包括：

选择所述互作蛋白质组中至少1个蛋白质作为目标结构，选择所述目标结构中的1个蛋白质作为蛋白质靶标，设置若干次结合肽长度，进行最大化的蒙特卡洛序列采样、最小化链间误差、最大化结合面积和结合界面之间的接触数量，最大化结合肽的模型置信度，生成结合序列；

对所述结合序列和所述蛋白质靶标进行结合分析计算，得到最优结合肽长度；

所述蛋白质靶标和所述最优结合肽长度生成的结合序列，即为最优结合序列；

对所述最优结合序列进行突变，生成候选序列组；依据序列恢复率和预测精度作为评分标准，至少选取所述候选序列组中评分排序前2的序列；将选取的序列分别进行和所述蛋白质靶标的相互作用、接触残基、结合能计算、结合面积计算，并进行亲水性参数计算，得到参数最优的序列即为所述蛋白互作抑制肽。

2.根据权利要求1所述的蛋白互作抑制肽的设计方法，其特征在于，所述结合肽长度大于等于12个氨基酸。

3.根据权利要求1所述的蛋白互作抑制肽的设计方法，其特征在于，所述若干次为至少1次。

4.根据权利要求1所述的蛋白互作抑制肽的设计方法，其特征在于，所述结合分析计算包括：对所述蛋白质靶标的构象、所述结合序列的构象、所述蛋白质靶标与所述结合序列结合的构象进行预测，相互作用和接触残基分析，结合能和结合面积计算。

5.一种蛋白互作抑制肽，其特征在于，采用权利要求1～4任一项所述的设计方法得到。

6.一种蛋白互作抑制肽，其特征在于，氨基酸序列为：SPQEFFDYFMHCMLN。

7.一种存储在计算机可读介质并且可加载到计算机的内部存储器中的计算机程序，包括软件代码部分，所述软件代码部分被布置成当所述程序在计算机上运行时，用于执行根据权利要求1～4中任一所述的设计方法。

8.权利要求1～4任一项所述的设计方法在蛋白互作抑制肽设计中的应用。