[发明专利]岩原鲤不同家系的鉴定方法在审
| 申请号: | 202211436088.2 | 申请日: | 2022-11-16 |
| 公开(公告)号: | CN115807107A | 公开(公告)日: | 2023-03-17 |
| 发明(设计)人: | 陶敏;丁严冬;宋江腾;李红涛;张俊华 | 申请(专利权)人: | 武汉中科瑞华生态科技股份有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 武汉宇晨专利事务所(普通合伙) 42001 | 代理人: | 余晓雪 |
| 地址: | 430077 湖北省武汉市武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 岩原鲤 不同 家系 鉴定 方法 | ||
1.一种用于鉴定岩原鲤的PCR引物,其特征在于:所述用于鉴定岩原鲤的PCR引物是岩原鲤双重PCR引物,所述岩原鲤双重PCR引物是5组,每组岩原鲤双重PCR引物分别包括两对引物序列;
所述岩原鲤双重PCR引物分别是:
第I组,包括YYL1引物对以及YYL2引物对;其中:YYL1的正向引物F是CGAGTGCGATTGCTG,反向引物R是GCGTCATAGGATGTAGTTT;YYL2的正向引物F是GCGTTACAATCACCT,反向引物R是TGTCTGTTCTCGCTCT;
第II组,包括YYL3引物对以及YYL4引物对;其中:YYL3的正向引物F是CGGCGTGATAACAATACAA,反向引物R是AATGCCAGTGAAGACCG;YYL4的正向引物F是GAGTCTTTGCTGATAAA,反向引物R是GAATTGTTGGCTTGG;
第III组,包括YYL5引物对以及YYL6引物对;其中:YYL5的正向引物F是CCTTATTACTCGCACG,反向引物R是AGCCATCAATACATCC;YYL6的正向引物F是GAACAAAGGAAAGCG,反向引物R是TGGGTGAATCAAAGA;
第IV组,包括YYL7引物对以及YYL8引物对;其中YYL7的正向引物F是TCCAAGACTGAATAT,反向引物R是AGTGCTTTGACTACAA;YYL8的正向引物F是GCATGTTGCTAGGATA,反向引物R是AGGCTTGCTGATAGG;
第V组,包括YYL9引物对以及YYL10引物对;其中:YYL9的正向引物F是GCTTCCTGCCTACAT,反向引物R是TATTCATCCTGGTCTC;YYL10的正向引物F是ATACTGTGGTTGACGG,反向引物R是TCACGCTATCTTATCAT。
2.如权利要求1所述的用于鉴定岩原鲤的PCR引物在鉴定岩原鲤时的应用。
3.如权利要求1所述的用于鉴定岩原鲤的PCR引物在鉴定区分岩原鲤不同家系时的应用。
4.一种基于如权利要求1所述的用于鉴定岩原鲤的PCR引物对岩原鲤不同家系的鉴定方法,其特征在于:所述鉴定方法包括以下步骤:
1)获取待鉴别的岩原鲤鳍条,从岩原鲤鳍条中提取岩原鲤DNA,所述待鉴别的岩原鲤至少是两个家系,每个家系至少包括两尾岩原鲤;
2)以步骤1)得到的岩原鲤DNA为模板,采用如权利要求1所述的用于鉴定岩原鲤的PCR引物进行PCR扩增,得到扩增产物;
3)对步骤2)得到的扩增产物使用聚丙烯酰胺胶进行电泳和银染;
4)将步骤3)中银染结果通过遗传分析软件进行分析,测量待鉴别的所有待鉴别的岩原鲤中每个个体之间的遗传距离,根据遗传距离绘制UPGMA聚类分析图,根据UPGMA聚类分析图所示的结果将待鉴别的岩原鲤的家系进行区分鉴定。
5.根据权利要求4所述的鉴定方法,其特征在于:所述步骤2)中PCR扩增的反应体系是15ul,其中:10×PCR Buffer 1.5ul,2.5mmol/L dNTP 0.5ul,2.0 mmol/L MgCl2 1.5ul,用于鉴定岩原鲤的PCR引物的正向引物F以及反向引物R各0.5ul,5 U/μL Taq酶0.5ul,DNA模板2ul,超纯水7ul。
6.根据权利要求5所述的鉴定方法,其特征在于:所述步骤2)中PCR扩增的反应程序是:94℃预变性3分钟;然后94℃变性30秒,56℃退火30秒,72℃延伸45秒,共35个循环;最后72℃延伸10分钟,4℃保存。
7.根据权利要求6所述的鉴定方法,其特征在于:所述步骤3)的具体实现方式是:对步骤2)得到的扩增产物使用12%的聚丙烯酰胺胶进行电泳和银染。
8.根据权利要求4-7任一项所述的鉴定方法,其特征在于:所述步骤4)中的遗传分析软件是MEGA软件。
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