[发明专利]岩原鲤不同家系的鉴定方法在审

专利信息
申请号: 202211436088.2 申请日: 2022-11-16
公开(公告)号: CN115807107A 公开(公告)日: 2023-03-17
发明(设计)人: 陶敏;丁严冬;宋江腾;李红涛;张俊华 申请(专利权)人: 武汉中科瑞华生态科技股份有限公司
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11
代理公司: 武汉宇晨专利事务所(普通合伙) 42001 代理人: 余晓雪
地址: 430077 湖北省武汉市武*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 岩原鲤 不同 家系 鉴定 方法
【权利要求书】:

1.一种用于鉴定岩原鲤的PCR引物,其特征在于:所述用于鉴定岩原鲤的PCR引物是岩原鲤双重PCR引物,所述岩原鲤双重PCR引物是5组,每组岩原鲤双重PCR引物分别包括两对引物序列;

所述岩原鲤双重PCR引物分别是:

第I组,包括YYL1引物对以及YYL2引物对;其中:YYL1的正向引物F是CGAGTGCGATTGCTG,反向引物R是GCGTCATAGGATGTAGTTT;YYL2的正向引物F是GCGTTACAATCACCT,反向引物R是TGTCTGTTCTCGCTCT;

第II组,包括YYL3引物对以及YYL4引物对;其中:YYL3的正向引物F是CGGCGTGATAACAATACAA,反向引物R是AATGCCAGTGAAGACCG;YYL4的正向引物F是GAGTCTTTGCTGATAAA,反向引物R是GAATTGTTGGCTTGG;

第III组,包括YYL5引物对以及YYL6引物对;其中:YYL5的正向引物F是CCTTATTACTCGCACG,反向引物R是AGCCATCAATACATCC;YYL6的正向引物F是GAACAAAGGAAAGCG,反向引物R是TGGGTGAATCAAAGA;

第IV组,包括YYL7引物对以及YYL8引物对;其中YYL7的正向引物F是TCCAAGACTGAATAT,反向引物R是AGTGCTTTGACTACAA;YYL8的正向引物F是GCATGTTGCTAGGATA,反向引物R是AGGCTTGCTGATAGG;

第V组,包括YYL9引物对以及YYL10引物对;其中:YYL9的正向引物F是GCTTCCTGCCTACAT,反向引物R是TATTCATCCTGGTCTC;YYL10的正向引物F是ATACTGTGGTTGACGG,反向引物R是TCACGCTATCTTATCAT。

2.如权利要求1所述的用于鉴定岩原鲤的PCR引物在鉴定岩原鲤时的应用。

3.如权利要求1所述的用于鉴定岩原鲤的PCR引物在鉴定区分岩原鲤不同家系时的应用。

4.一种基于如权利要求1所述的用于鉴定岩原鲤的PCR引物对岩原鲤不同家系的鉴定方法,其特征在于:所述鉴定方法包括以下步骤:

1)获取待鉴别的岩原鲤鳍条,从岩原鲤鳍条中提取岩原鲤DNA,所述待鉴别的岩原鲤至少是两个家系,每个家系至少包括两尾岩原鲤;

2)以步骤1)得到的岩原鲤DNA为模板,采用如权利要求1所述的用于鉴定岩原鲤的PCR引物进行PCR扩增,得到扩增产物;

3)对步骤2)得到的扩增产物使用聚丙烯酰胺胶进行电泳和银染;

4)将步骤3)中银染结果通过遗传分析软件进行分析,测量待鉴别的所有待鉴别的岩原鲤中每个个体之间的遗传距离,根据遗传距离绘制UPGMA聚类分析图,根据UPGMA聚类分析图所示的结果将待鉴别的岩原鲤的家系进行区分鉴定。

5.根据权利要求4所述的鉴定方法,其特征在于:所述步骤2)中PCR扩增的反应体系是15ul,其中:10×PCR Buffer 1.5ul,2.5mmol/L dNTP 0.5ul,2.0 mmol/L MgCl2 1.5ul,用于鉴定岩原鲤的PCR引物的正向引物F以及反向引物R各0.5ul,5 U/μL Taq酶0.5ul,DNA模板2ul,超纯水7ul。

6.根据权利要求5所述的鉴定方法,其特征在于:所述步骤2)中PCR扩增的反应程序是:94℃预变性3分钟;然后94℃变性30秒,56℃退火30秒,72℃延伸45秒,共35个循环;最后72℃延伸10分钟,4℃保存。

7.根据权利要求6所述的鉴定方法,其特征在于:所述步骤3)的具体实现方式是:对步骤2)得到的扩增产物使用12%的聚丙烯酰胺胶进行电泳和银染。

8.根据权利要求4-7任一项所述的鉴定方法,其特征在于:所述步骤4)中的遗传分析软件是MEGA软件。

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