[发明专利]蒙古鲌分布和迁移评估方法在审
| 申请号: | 202211436086.3 | 申请日: | 2022-11-16 |
| 公开(公告)号: | CN115807106A | 公开(公告)日: | 2023-03-17 |
| 发明(设计)人: | 陶敏;李红涛;宋江腾;李妮娅;张俊华 | 申请(专利权)人: | 武汉中科瑞华生态科技股份有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 武汉宇晨专利事务所(普通合伙) 42001 | 代理人: | 余晓雪 |
| 地址: | 430077 湖北省武汉市武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 蒙古 分布 迁移 评估 方法 | ||
1.一种蒙古鲌鉴定用引物,其特征在于:所述蒙古鲌鉴定用引物是蒙古鲌双重PCR微卫星引物,所述蒙古鲌双重PCR微卫星引物是5组,每组蒙古鲌双重PCR微卫星引物包括两对引物序列,5组蒙古鲌双重PCR微卫星引物分别是:
第I组,包括蒙1引物对以及蒙2引物对;其中,蒙1引物对的正向引物F是AGCACCTTATTTCTCCCACTT,反向引物R是GGCGTGCTTCACTTCTCTCT;蒙2引物对的正向引物F是CAATGGAAGGTCAAGCCAAT,反向引物R是GGAATGTCCCCACAATTCGC;
第II组,包括蒙3引物对以及蒙4引物对;其中,蒙3引物对的正向引物F是TGATGCATGTAGCGCCTCAC,反向引物R是AGATCATGTGGGGTCTGTGAC;蒙4引物对的正向引物F是AGCTGGGCTGAGAGCAGAAG,反向引物R是GCAACCAGGGACGTACATAT;
第III组,包括蒙5引物对以及蒙6引物对;其中,蒙5引物对的正向引物F是CCCGAGCCTTACTCCTTTCT,反向引物R是CTCAGAGGCGAGAAAACCAG;蒙6引物对的正向引物F是ACAATCCGCCACCTAGGAAC,反向引物R是AACAAGAAGCCAAGGCAAGA;
第IV组,包括蒙7引物对以及蒙8引物对;其中,蒙7引物对的正向引物F是GCAGAGATGGAGGAGGATGT,反向引物R是CGGATGGTTCCTGGATAAAG;蒙8引物对的正向引物F是CAATGTACGCCTTGGGTTTT,反向引物R是TGGCAGCTTTGCAAATACAC;
第V组,包括蒙9引物对以及蒙10引物对;其中,蒙9引物对的正向引物F是GCTCATGTCCGATATTGGTG,反向引物R是CCATCTTTGTGGGGACATTT;蒙10引物对的正向引物F是AAACAGGGCTGAATGCTTTG,反向引物R是TGAGGGAGGTACCAGTTGAG。
2.一种基于如权利要求1所述的蒙古鲌鉴定用引物在鉴定蒙古鲌时的应用。
3.一种基于如权利要求1所述的蒙古鲌鉴定用引物在鉴定蒙古鲌亲缘关系的应用。
4.一种基于如权利要求1所述的蒙古鲌鉴定用引物的蒙古鲌的分布和迁移评估方法,其特征在于:所述评估方法包括以下步骤:
1)挑选N个蒙古鲌家系的健康蒙古鲌,每个蒙古鲌家系中均包括M尾健康蒙古鲌;
2)在步骤1)挑选得到的健康蒙古鲌体内植入超声波标记物,并将蒙古鲌养殖至伤口愈合;每个蒙古鲌家系的健康蒙古鲌中植入超声波标记物的数量是S,所述S≥5%M;
3)将伤口愈合的蒙古鲌以及除超声波标记物标记外剩余的健康蒙古鲌在流动水域放流;
4)对放流的蒙古鲌进行移动追踪及固定监测,获取蒙古鲌的移动数据;
5)根据步骤4)的结果,在流动水域中对蒙古鲌进行回捕;
6)利用如权利要求1所述的蒙古鲌鉴定用引物对回捕得到的蒙古鲌进行亲缘关系鉴定;
7)计算在回捕蒙古鲌时所在流动水域中的所有蒙古鲌的数量;
8)根据步骤7)的结果对蒙古鲌的分布和迁移进行评估。
5.根据权利要求4所述的评估方法,其特征在于:所述步骤6)的具体实现方式是:
6.1)从回捕得到的蒙古鲌的鳍条中提取DNA;
6.2)利用如权利要求1所述的蒙古鲌鉴定用引物对步骤6.1)所得到的DNA进行PCR扩增,得到扩增产物;
6.3)将扩增产物在10%的聚丙烯酰胺胶上进行电泳分离;
6.4)使用mega5.0软件和population软件对步骤6.3)的分离结果做聚类发育树;
6.5)根据6.4)所得到的聚类发育树鉴定回捕得到的蒙古鲌的亲缘关系。
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