[发明专利]一种基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法在审

专利信息
申请号: 202111020697.5 申请日: 2021-09-01
公开(公告)号: CN113658639A 公开(公告)日: 2021-11-16
发明(设计)人: 叶绍云;蒋峻峰;杨小娟;刘雨 申请(专利权)人: 新起点生物科技(苏州)有限公司
主分类号: G16B25/20 分类号: G16B25/20
代理公司: 苏州思睿晶华知识产权代理事务所(普通合伙) 32403 代理人: 吴碧骏
地址: 215000 江苏省苏州市中国(江苏)自由贸易*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 核酸 平台 体细胞 突变 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

获取待检测基因;

对所述待检测基因执行序列分析操作,得到待测突变位点;

根据所述待测突变位点设计PCR扩增引物、SAP反应试剂、单碱基延伸阻遏引物和野生型阻遏探针;

通过所述PCR扩增引物对所述待检测基因执行扩增操作,得到PCR产物;

通过所述SAP反应试剂对所述PCR产物执行SAP反应操作,得到消化产物;

通过所述单碱基延伸阻遏引物对所述消化产物执行延伸反应操作,得到延伸产物;

对所述延伸产物执行点样操作,获得点样数据;

对所述点样数据进行分析,获得待检测基因突变类型。

2.根据权利要求1所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:

所述执行序列分析操作的步骤进一步包括:对所述待检测基因的区域DNA序列和氨基酸序列进行分析,获取待测突变位点序列信息,得到所述待测突变位点。

3.根据权利要求1所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:

所述PCR扩增引物包括第一PCR扩增引物1st-PCRP和第二PCR扩增引物2nd-PCRP。

4.根据权利要求3所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:

所述第一PCR扩增引物和所述第二PCR扩增引物中的正向引物或反向引物的5'末端增加通用序列ACGTTGGATG。

5.根据权利要求4所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:

所述执行扩增操作的步骤进一步包括:将所述待测突变位点的所述第一PCR扩增引物和所述第二PCR扩增引物进行混合,得到混合工作液,通过单一引物浓度为0.5μM-1μM对所述待检测基因的DNA进行扩增,得到所述PCR产物。

6.根据权利要求1所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:

所述执行SAP反应操作的步骤进一步包括:将执行扩增操作后的反应体系与所述SAP反应试剂进行混合,消除所述反应体系中剩余的引物和dNTP,得到所述消化产物。

7.根据权利要求1所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:

所述执行延伸反应操作的步骤进一步包括:将所述消化产物与所述单碱基延伸阻遏引物进行混合,得到所述延伸产物;

8.根据权利要求1所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:

所述野生型阻遏探针的5'末端用5`C3 Spacer或者5`P修饰,3'末端3`MGB修饰,熔点温度值范围65℃~72℃。

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