[发明专利]一种基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法在审
| 申请号: | 202111020697.5 | 申请日: | 2021-09-01 |
| 公开(公告)号: | CN113658639A | 公开(公告)日: | 2021-11-16 |
| 发明(设计)人: | 叶绍云;蒋峻峰;杨小娟;刘雨 | 申请(专利权)人: | 新起点生物科技(苏州)有限公司 |
| 主分类号: | G16B25/20 | 分类号: | G16B25/20 |
| 代理公司: | 苏州思睿晶华知识产权代理事务所(普通合伙) 32403 | 代理人: | 吴碧骏 |
| 地址: | 215000 江苏省苏州市中国(江苏)自由贸易*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 核酸 平台 体细胞 突变 检测 方法 | ||
1.一种基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
获取待检测基因;
对所述待检测基因执行序列分析操作,得到待测突变位点;
根据所述待测突变位点设计PCR扩增引物、SAP反应试剂、单碱基延伸阻遏引物和野生型阻遏探针;
通过所述PCR扩增引物对所述待检测基因执行扩增操作,得到PCR产物;
通过所述SAP反应试剂对所述PCR产物执行SAP反应操作,得到消化产物;
通过所述单碱基延伸阻遏引物对所述消化产物执行延伸反应操作,得到延伸产物;
对所述延伸产物执行点样操作,获得点样数据;
对所述点样数据进行分析,获得待检测基因突变类型。
2.根据权利要求1所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:
所述执行序列分析操作的步骤进一步包括:对所述待检测基因的区域DNA序列和氨基酸序列进行分析,获取待测突变位点序列信息,得到所述待测突变位点。
3.根据权利要求1所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:
所述PCR扩增引物包括第一PCR扩增引物1st-PCRP和第二PCR扩增引物2nd-PCRP。
4.根据权利要求3所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:
所述第一PCR扩增引物和所述第二PCR扩增引物中的正向引物或反向引物的5'末端增加通用序列ACGTTGGATG。
5.根据权利要求4所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:
所述执行扩增操作的步骤进一步包括:将所述待测突变位点的所述第一PCR扩增引物和所述第二PCR扩增引物进行混合,得到混合工作液,通过单一引物浓度为0.5μM-1μM对所述待检测基因的DNA进行扩增,得到所述PCR产物。
6.根据权利要求1所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:
所述执行SAP反应操作的步骤进一步包括:将执行扩增操作后的反应体系与所述SAP反应试剂进行混合,消除所述反应体系中剩余的引物和dNTP,得到所述消化产物。
7.根据权利要求1所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:
所述执行延伸反应操作的步骤进一步包括:将所述消化产物与所述单碱基延伸阻遏引物进行混合,得到所述延伸产物;
8.根据权利要求1所述的基于核酸质谱平台体细胞突变超敏检测方法,其特征在于:
所述野生型阻遏探针的5'末端用5`C3 Spacer或者5`P修饰,3'末端3`MGB修饰,熔点温度值范围65℃~72℃。
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