[发明专利]一种与肉兔免疫性状相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明涉及一种与肉兔免疫性状相关的SNP分子标记及其应用，所述SNP分子标记位于肉兔CAST基因第25外显子区。本发明筛选得到的与肉兔免疫性状相关的SNP分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，在所述序列的第188位碱基处存在一个C/T的等位基因突变，该突变引起所示序列的核苷酸产生多态性。本发明为用于非诊断目的的肉兔免疫性状标记辅助选择提供了新的SNP分子标记资源。

技术领域

本发明属于兔的分子标记制备技术领域，具体涉及一种与肉兔免疫性状相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

肉兔具有经济价值高、用途广、高产低耗和见效快等优点，随着人们生活水平不断提高以及对外出口不断增加，养兔业已经成为畜牧业的新亮点，具有广阔的发展前景。然而，肉兔品种退化严重，饲料营养不均衡、疾病防治体系不健全及饲养技术落后影响整个养兔业的发展进程。种业是影响养兔业最重要的环节之一，决定肉兔生产水平的关键是育种。中国养兔历史悠久，但肉兔专业育种工作起步较晚，与养兔发达国家及中国其他畜禽育种相比，尚存在较大的差距随着分子数量遗传学和生物技术的发展，中国肉兔育种逐渐由传统育种的方法向传统育种和分子育种相结合方法转变，并取得了较好的进展。

SNP（单核苷酸多态性）分子标记是基因序列单个核苷酸发生变异而产生多态性的DNA分子标记之一，主要表现为基因组同一位点上单个核苷酸的变异，包括转换、颠换、缺失和插入，是二等位基因多态。SNP标记具有分布广泛，遗传稳定，并且适宜高通量自动化分析。在肉兔育种中，人们希望通过对与生产性状密切相关的SNP分子标记的选择，期望达到提高育种效率，获得更大的育种进展的目的。

免疫球蛋白G（IgG）与动物的抗病力密切相关。一般来说IgG数值越高，抗病力就越强。而抗病力的增强可减少药物的使用，降低生产成本，增加养殖效益，同时也是老百姓放心食用肉类的重要保障。因此，筛选与肉兔免疫性状相关联的SNP分子标记具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与肉兔免疫性状相关的SNP分子标记及其应用。

为实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

一种与肉兔免疫性状相关的SNP分子标记，该SNP分子标记从肉兔 CAST基因第25外显子区域（登录号：NC_013679.1）克隆得到，其核苷酸序列如下所示：

5’-TCCCAGACCAGTCAGGTTCACGGTTGCCACAGCTCCTGTGTTTGTCTCGGTGCTTCTCTGCCCCTGTCCTCCAAGGAAGCGGGGCCCCTCTTGCAAACGCAGCCCCTCCCTGGGCTGATCTGACAGAGTTTGGACTGCCCGTGACTGAGGGAGAATTATTTGCCTTTTAGCCCAGCAACAAGGAACTYGACGATGCCTTGGATAAACTTTCTGACAGTCTTGGCCAAAGGCAGCCTGATCCCGATGAGAACAAGCCCATGGAGGACAAAGTGA-3’（SEQ ID No.1）；

上述核苷酸序列中的第188bp处的Y是C或T，导致多态性。

上述核苷酸序列中的第188bp处的Y与肉兔免疫球蛋白G含量关联。

一种用于检测上述分子标记的引物对，该引物对的核酸序列如下：

上游引物（SEQ ID No.2）：5’-TCCCAGACCAGTCAGGTTCA-3’；

下游引物（SEQ ID No.3）：5’-TCACTTTGTCCTCCATGGGC-3’。

一种用于检测上述分子标记的用于基因分型的延伸引物对，该引物对的核酸序列如下：