[发明专利]口腔中幽门螺杆菌耐药性分型检测的方法和试剂盒

权利要求书

1.一种检测和判定幽门螺旋杆菌耐药性的诊断方法，其特征在于，此方法为非侵入性诊断，该幽门螺旋杆菌的来源为口腔内唾液及牙菌斑。

2.应用如权利要求1所述的诊断方法，其特征在于，采用巢氏PCR技术结合测序技术，灵敏度、特异性与准确率较高。

3.应用如权利要求1所述的诊断方法，其特征在于，口腔内唾液及牙菌斑标本进行全基因组提取时，采用改良的碘化钾提取方法，整个提取流程操作简单、耗时短、成本低，与试剂盒法相比，得到的后续PCR结果相同，能够满足当前实验需求，适合于临床样本的快速提取。

4.应用如权利要求1所述的诊断方法，其特征在于，包括对克拉霉素、左氧氟沙星、阿莫西林、四环素、呋喃唑酮、利福平、甲硝唑耐药基因的耐药相关突变区域进行PCR引物设计的步骤；

其中，克拉霉素耐药基因23SrRNA突变区域的引物为F1和R1；

阿莫西林耐药基因PBP1突变区域的引物为F2和R2；

四环素耐药基因16SrRNA突变区域的引物为F3和R3；

左氧氟沙星耐药基因gyrA突变区域的引物为F4和R4；

呋喃唑酮耐药基因porD突变区域的引物为F5和R5；

呋喃唑酮耐药基因oorD突变区域的引物为F6和R6；

利福平耐药基因rpoB突变区域的引物为F7和R7；

甲硝唑耐药基因rdxA突变区域的引物为F8和R8。

5.应用如权利要求1所述的诊断方法，其特征在于，包括对克拉霉素耐药基因进行巢氏PCR引物设计的步骤；

其中，克拉霉素耐药基因23SrRNA基因位点G1939A、T1942C的引物为F9和R9；

克拉霉素耐药基因23SrRNA基因位点G2111A、A2115G、A2116G、T2117C、G2141A、A2142G、A2142G/C/T、A2143G/C/T、A2144G、A2146G、C2147G、G2172T、T2182C、C2224A、T2243C、C2245T、C2289T的引物为F10和R10；

克拉霉素耐药基因23SrRNA基因位点C2611A、C2694A与T2717C的引物为F1和R11；

其特征在于，包括对阿莫西林耐药基因的进行巢氏PCR引物设计的步骤；

其中，阿莫西林耐药基因PBP1基因位点A320V的引物为F12和R12；

阿莫西林耐药基因PBP1基因位点F366L、A369T及V374L的引物为F13和R13；

阿莫西林耐药基因PBP1基因位点S414R与L423F的引物为F14和R14；

阿莫西林耐药基因PBP1基因位点T556S、N562Y、T593A、G595S及A599T的引物为F15和R15；

其特征在于，包括对四环素耐药基因的进行巢氏PCR引物设计的步骤；

其中，四环素耐药基因16SrRNA基因位点AGA926-928TTC\AGC\TGC\GGA\CGA\ATC\GTA\GCA的引物为F16和R16；

其特征在于，包括对左氧氟沙星耐药基因的进行巢氏PCR引物设计的步骤；

左氧氟沙星耐药基因GYRA基因位点N87L\I\A\Y\K，D 91A\G\Y\N\H及A 88N\V、的引物为F17和R17。

其特征在于，包括对呋喃唑酮耐药基因的进行巢氏PCR引物设计的步骤；

其中，呋喃唑酮耐药基因porD基因位点C346A、C347T\G、G353A、A356G及C357T的引物为F18和R18；

呋喃唑酮耐药基因oorD基因位点A41G、A78G、A112G、A122G、C156T及C165T的引物为F19和R19；

呋喃唑酮耐药基因oorD基因位点A335G及C349A\G的引物为F20和R20；

其特征在于，包括对利福平耐药基因的进行巢氏PCR引物设计的步骤；

其中，利福平耐药基因rpoB基因位点L525I\P、S526L、Q527K\R、D530Y\N\I\G\V\L\F、H540A\N\Y、I 586P\N\L、V147F、T62C、D540V\L、S545L及Q527R的引物为F21和R21。

其特征在于，包括对甲硝唑耐药基因的进行巢氏PCR引物设计的步骤；

其中，甲硝唑耐药基因rdxA随机突变位点的引物为F22～29、R22～29。

6.应用如权利要求1-11任一所述诊断方法的试剂盒。