[发明专利]检测铂类药物相关基因多态性位点的引物组及检测方法在审

专利信息
申请号: 201811654875.8 申请日: 2018-12-30
公开(公告)号: CN109385480A 公开(公告)日: 2019-02-26
发明(设计)人: 赵薇薇;朱阳进;胡昌明;严慧;徐艳艳;汤愿笑;甘立佳;于世辉 申请(专利权)人: 广州金域医学检验中心有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6872;C12N15/11
代理公司: 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 代理人: 李永宏
地址: 510000 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 引物组 铂类药物 相关基因 多态性位点 检测 引物组合 基因多态性检测 结果判读 多态性 无干扰 种检测
【说明书】:

发明公开了一种检测铂类药物相关基因多态性位点的引物组及检测方法,涉及基因多态性检测技术领域。该引物组包括引物组合1‑引物组合5中的一种或多种的组合。采用该引物组可以同时对5个铂类药物相关基因的5个SNP位点的多态性进行检测,具有成本低、结果判读简单,SNP位点之间无干扰等特点。

技术领域

本发明涉及基因多态性检测技术领域,具体而言,涉及一种检测铂类药物相关基因多态性位点的引物组及检测方法。

背景技术

铂类药物开发于20世纪60年代,目前铂类药物因其具有独特的抗癌机制和广泛的抗癌谱,已成为目前临床上使用最广的化疗药物之一。目前铂类药物被广泛用于肺癌、膀胱癌、卵巢癌、宫颈癌、食管癌、胃癌、结肠癌和头颈部肿瘤等。

铂类药物是细胞非特异性药物,可以进入细胞与DNA形成Pt-DNA,进而导致肿瘤细胞坏死或是凋亡以达到抗癌效果。与此同时,根据个人的基因水平,铂类药物产生的药效和引起的毒副作用存在较大差异。

铂类药物进入细胞后会引起肿瘤细胞DNA损伤,而DNA损伤则会通过细胞内的核苷酸切除修复途径进行修复,其中ERCC1、ERCC2基因在这一修复途径中发挥了巨大作用,基因的过度表达可使停滞在G2/M期的损伤DNA迅速修复而产生对铂类药物的耐药性。

除了ERCC1、ERCC2基因外,XRCC1可参与碱基切除对DNA进行修复,GSTs(谷胱甘肽-s-转移酶)可参与铂类药物灭活而引起对铂类耐药。因此目前临床上已开展检查铂类药物相关基因的基因型来预测判断药物治疗的疗效,并根据患者的基因型选取合适的药物,即根据个体遗传特征(基因型),选择有效的治疗方案。实现“基因导向型”个体化药物治疗和“量体用药”。

传统的检测方法主要为sanger测序、片段分析或是单碱基延伸技术,每个反应仅检测1个或是几个基因位点。其存在检测效率低,通量低的问题。传统的检测方法完成一次检测周期较长,需要实验人员较多;同时检测配套试剂中,需要荧光标记引物或ddNTP或长片段引物,成本较高。由于药物代谢基因在基因组中存在有较多重复序列,传统的检测方法对基因难扩增、难检测。传统的检测方法实验流程长,样品孔反复开盖、加样次数多;同时同一反应内多个基因位点竞争性扩增,相关干扰大。传统检测方法得到的原始结果均无法在仪器上直观显示检测结果,需要实验员自行设置参数分析,结果判读复杂。传统的检测方法需要用到荧光标记的引物或ddNTP或是长片段引物,在室温或是光照条件下暴露较长时间,或是反复冻融次数过多极易导致检测失败,失败率高。

鉴于此,特提出本发明。

发明内容

本发明的目的在于提供一种检测铂类药物相关基因多态性位点的引物组,采用该引物组可以同时对5个铂类药物相关基因的5个SNP位点的多态性进行检测,具有成本低、结果判读简单,SNP位点之间无干扰等特点。

本发明的另一目的在于提供一种用于铂类药物相关基因多态性位点检测的试剂盒,采用该试剂盒可以同时对5个铂类药物相关基因的5个SNP位点的多态性进行检测,具有成本低、结果判读简单,SNP位点之间无干扰等特点。

本发明的另一目的在于提供一种检测铂类药物相关基因多态性位点的方法,该方法可以同时对5个铂类药物相关基因的5个SNP位点的多态性进行检测,具有成本低、结果判读简单,SNP位点之间无干扰等特点。

本发明是这样实现的:

一方面,本发明提供了一种检测铂类药物相关基因多态性位点的引物组,其包括引物组合1-引物组合5中的一种或多种的组合;

其中,引物组合1包括:SEQ ID NO.1-2所示的扩增引物和SEQ ID NO.11所示的检测引物;

引物组合2包括:SEQ ID NO.3-4所示的扩增引物和SEQ ID NO.12所示的检测引物;

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