[发明专利]用于检测生物样品中病原体的方法和系统有效
| 申请号: | 201280070778.9 | 申请日: | 2012-12-27 |
| 公开(公告)号: | CN104169719A | 公开(公告)日: | 2014-11-26 |
| 发明(设计)人: | 约瑟夫·乔尔·波拉克;丹尼尔·莱夫纳;约纳坦·毕鲁;阿尔农·亚芬;诺姆·约拉夫-拉斐尔;尤沃·格林菲尔德 | 申请(专利权)人: | 赛特诊断有限公司 |
| 主分类号: | G01N33/49 | 分类号: | G01N33/49;G01N33/52;G06T7/60 |
| 代理公司: | 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 | 代理人: | 高瑜;郑霞 |
| 地址: | 以色列*** | 国省代码: | 以色列;IL |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 检测 生物 样品 病原体 方法 系统 | ||
1.一种检测样品中病原体感染的方法,所述方法包括:
-用两种或更多种染料染色所述样品,所述两种或更多种染料包括主要染色DNA的至少一种染料,以由此在DNA和不同于DNA的至少一种其他细胞组分之间提供差别染色;
-如果所述DNA存在于样品中,鉴定包含所述DNA的至少第一染色区,以及包含所述其他细胞组分的至少一个其他染色区;
-提取所述第一染色区和所述至少一个其他染色区的结构特征,所述结构特征包括以下中的至少一个:(i)所述第一染色区和一个其他染色区的至少一个的大小和(ii)所述第一染色区和所述至少一个其他染色区关于彼此的位置;
-如果第一染色区被鉴定且所述结构特征符合预定为表征可疑病原体的结构特征,则确定指示所述身体样品中的所述可疑病原体的存在的值或值的组合。
2.如权利要求1所述的方法,其中至少一种其他染料主要染色除了DNA外的细胞组分。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中所述至少一种其他染料主要染色选自由以下组成的组的细胞组分:RNA、蛋白质、脂质、膜、细胞质、核糖体、碳水化合物、葡聚糖、糖蛋白、内质网、或其任何组合。
4.如权利要求1至3的任一项所述的方法,其中所述一种或更多种染料对细胞类型是非特异的。
5.如权利要求1至4的任一项所述的方法,其中所述一种或更多种染料选自由以下组成的组:吖啶橙(AO)、Hoechst家族、结晶紫、DAPI、伊红、溴化乙锭、碘化丙锭、SYBR家族、YOYO、TOTO、苏木精、番红、DRAQ-家族、SYTO家族。
6.如权利要求5所述的方法,其中所述第一染色区由Hoechst染色来提供且所述第二染色区由AO来提供。
7.如权利要求6所述的方法,其中所述Hoechst染色由选自由以下组成的组的Hoechst着色剂来提供:Hoechst 33258、Hoechst 33342、Hoechst34580、Hoechst S769121。
8.如权利要求1至7的任一项所述的方法,其中所述样品为身体样品。
9.如权利要求8所述的方法,其中所述身体液体样品选自由以下组成的组:血液、唾液、精液、汗液、痰、阴道分泌物、粪便、乳汁、泪液、鼻涕。
10.如权利要求9所述的方法,其中所述身体液体样品选自由以下组成的组:全血样品和红细胞样品。
11.如权利要求1至10的任一项所述的方法,其中所述病原体是携带DNA的病原体。
12.如权利要求11所述的方法,其中所述病原体是寄生物。
13.如权利要求12所述的方法,其中所述寄生物是原生动物。
14.如权利要求13所述的方法,其中所述原生动物选自由以下组成的组:锥虫属物种(Trypanosoma species)、利什曼原虫属物种(Leishmania species)、疟原虫属物种(Plasmodium species)、弓形虫(Toxoplasma gondii)、和巴贝斯虫属物种(Babesia species)。
15.如权利要求13所述的方法,其中所述原生动物为引起人类疟疾的疟原虫属物种且选自由以下组成的组:恶性疟原虫(P.falciparum)、间日疟原虫(P.vivax)、卵形疟原虫(P.ovale)和三日疟原虫(P.malariae)。
16.如权利要求1至15的任一项所述的方法,其中提取结构特征包括选择所述样品中包括所述第一染色区和所述一个其他染色区的染色的对象,以及对于所述染色的对象,如果
-鉴定了第一染色区,且
以下的至少一个出现:
i)所述第一染色区邻接或位于所述一个其他染色区的边界内;以及
ii)所述第一染色和所述一个其他染色的至少一个的大小在预定的范围内,
则确定指示所述样品中可疑病原体的存在的值或值的组合。
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