[发明专利]一种检测K-ras基因突变的方法及试剂盒有效
申请号: | 201110330793.X | 申请日: | 2011-10-27 |
公开(公告)号: | CN102399872A | 公开(公告)日: | 2012-04-04 |
发明(设计)人: | 李凯;张佳;王庆琳;肖莉;王伟大;姬云 | 申请(专利权)人: | 苏州科贝生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 | 代理人: | 陶海锋 |
地址: | 215123 江苏省苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 ras 基因突变 方法 试剂盒 | ||
1.一种检测K-ras基因突变的试剂盒,包括:常规PCR组件,其特征在于,还包括特异性引物;所述特异性引物包括三条正向引物和一条反向引物,并且每一条正向引物的三末端第二个碱基为硫化修饰碱基;其中三条正向引物的序列分别具有SEQ ID No.1、SEQ ID No.2、SEQ ID No.3所示核苷酸序列,所述反向引物具有SEQ ID No.4所示核苷酸序列;所述特异性引物的核苷酸序列具体如下所示:
SEQ ID No.1:5’-TTGTGGTAGTTGGAGCTGAT-3’;
SEQ ID No.2:5’-TTGTGGTAGTTGGAGCTGTT-3’;
SEQ ID No.3:5’-TGGTAGTTGGAGCTGGTGAC-3’;
SEQ ID No.4:5’-TCTGTATCAAAGAATGGTCC-3’;
所述常规PCR组件包括:高保真DNA聚合酶Pfu酶,含有硫酸镁的Pfu缓冲液,dNTPs。
2.根据权利要求1所述检测K-ras基因突变的试剂盒,其特征在于,所述检测K-ras基因突变的试剂盒还包括三个检测位点的阳性对照突变质粒,所述三个检测位点的阳性对照突变质粒分别为:pGEM-T质粒载体插入包含K-ras基因12号密码子GGT-GAT的突变序列,pGEM-T质粒载体插入包含K-ras基因12号密码子GGT-GTT的突变序列,pGEM-T质粒载体插入包含K-ras基因13号密码子GGC-GAC的突变序列。
3.采用权利要求1所述检测K-ras基因突变的试剂盒检测待测样本是否存在K-ras基因突变的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)采用常规方法提取待测组织样本基因组DNA或外周血游离DNA;
(2)以步骤(1)所得样本基因组DNA或外周血游离DNA为模板,采用特异性引物进行多重PCR扩增,根据PCR扩增的结果判断样本中是否含有K-ras基因的3个热点突变中的至少一种;判断规则为:如果出现扩增产物,则表明样本中含有上述3个热点突变中的至少一种;如果没有出现扩增产物,则表明样本中不含上述3个热点突变中的任意一种;所述3个热点突变为:12号密码子GGT-GAT突变,12号密码子GGT-GTT突变,13号密码子GGC-GAC突变。
4.根据权利要求3所述检测K-ras基因突变的试剂盒检测待测样本是否存在K-ras基因突变的方法,其特征在于,进行多重PCR扩增时,每25μL的多重PCR扩增体系包括:1μL模板,2.5μL 10×含有硫酸镁的Pfu缓冲液,1.5μL反向引物,三条正向引物各0.5μL,0.2μL Pfu酶,0.4μL dNTPs,剩下加水补足;多重PCR反应条件为:95℃预变性5分钟,95℃变性20秒,68℃退火20秒,退火温度每个循环递减1℃,72℃延伸30秒,共10个循环;95℃变性20秒,59℃退火20秒,72℃延伸30秒,共35个循环,最后72℃延伸10分钟。
5.如SEQ ID No.1所述的核苷酸序列。
6.如SEQ ID No.2所述的核苷酸序列。
7.如SEQ ID No.3所述的核苷酸序列。
8.如SEQ ID No.4所述的核苷酸序列。
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