[发明专利]生物素-亲和素系统检测单核苷酸多态性的方法无效
| 申请号: | 201010503018.5 | 申请日: | 2010-10-12 |
| 公开(公告)号: | CN101974625A | 公开(公告)日: | 2011-02-16 |
| 发明(设计)人: | 贺林;李璨;张钊;陈培华 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学;上海佰真生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海交达专利事务所 31201 | 代理人: | 王锡麟;王桂忠 |
| 地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 生物素 亲和 系统 检测 核苷酸 多态性 方法 | ||
1.一种生物素-亲和素系统检测单核苷酸多态性的方法,其特征在于,包括如下步骤:
第一步,利用DNA折纸术构造一个非对称二维图形,制备DNA折纸芯片;
第二步,末端修饰生物素的报告探针与DNA折纸芯片杂交;
第三步,链霉亲和素与生物素连接;
第四步,单核苷酸多态性检测;
第五步,原子力显微镜成像。
2.根据权利要求1所述的生物素-亲和素系统检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第一步中所述的DNA折纸芯片的制备方法:
(1)把所有要用的100μM订书钉链,包括形成非对称二维图形的、伸出探针的等体积混合,再稀释20倍备用;
(2)在96孔板上混合总量为30μl的溶液:0.025μM订书钉链:22μl;1/2浓度的M13mp18:1μl;1×TAE-Mg2+buffer:7μl。
3.根据权利要求1所述的生物素-亲和素系统检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第二步中所述的杂交的方法是指报告探针比捕获探针按摩尔浓度比1.2比1的比例加入略微过量的报告探针,37℃杂交半小时。
4.根据权利要求1所述的生物素-亲和素系统检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第三步所述的连接是指链霉亲和素∶生物素按摩尔浓度比1.2比1的比例加入略微过量的链霉亲和素,37℃反应一小时。
5.根据权利要求1所述的生物素-亲和素系统检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第四步所述的检测是指在原子力显微镜成像前,加入报告探针摩尔浓度2倍量的靶核苷酸链,取加前、加后15分钟、加后1小时,加后3小时的时间点原子力显微镜成像。
6.根据权利要求1所述的生物素-亲和素系统检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,第五步所述的成像是指吸取2-5μl样品滴到新切云母表面,吸附2分钟后即可拿到原子力显微镜下成像。
7.根据权利要求6所述的生物素-亲和素系统检测单核苷酸多态性的方法,其特征是,所述的原子力显微镜成像,原本都是有亮点的,在某一时间后,完全互补的已没有亮点,根据分支迁移反应机制,加入两种toehold长短不同靶核苷酸链,单碱基突变的仍有明显亮点。
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